С 1 октября 2020 года к Сахалинской таможне присоединят Камчатскую и Магаданскую таможни. В составе Сахалинской таможни после реорганизации будет 11 таможенных постов. Местонахождение, регион деятельности  и штатная численность таможенных постов не изменятся.
 
Предстоящее реформирование позволит более эффективно использовать ресурсы таможенных органов, повысит качество таможенного администрирования.
 
Несмотря на то, что с 1 октября 2020 года регион деятельности Сахалинской таможни значительно расширится, это не скажется на эффективности таможенного контроля и сроках таможенного оформления. Сегодня большая часть деклараций на товары оформляется в центрах электронного декларирования (ЦЭД). В Дальневосточном регионе основной декларационный массив к концу 2020 года будет сконцентрирован в двух ЦЭДах, подчиненных Владивостокской таможне и Дальневосточной электронной таможне. ЦЭД Владивостокской таможни  продолжит оформлять товары, перемещаемые морским транспортом, ЦЭД Дальневосточной электронной таможни будет оформлять товары, перемещаемые иными видами транспорта.
 
Приказ Федеральной таможенной службы от 27 марта 2020 г. №329 «О реорганизации Камчатской, Магаданской и Сахалинской таможен».
 
С 1 октября 2020 года регион деятельности Сахалинской таможни: Камчатский край, Магаданская область, Чукотский автономный округ, Сахалинская область, акватория вод территориального моря Российской федерации, омывающего берега указанных административных образований.
 
Юлия Ждахина